なにかつくってひまつぶし

セカンドライフで化学の勉強しましょう～。


●　炭素多面体フラーレン　（fullerene）
　　分子式：C60




●　ガスハイドレート　（Gas Hydrate Cage Type_H）




前回の記事　「Blenderで描いたベジエ曲線座標をスクリプトで取り込む」　を読んでくださった、理科の先生から
「分子構造を作れたらおもしろいですね。」
とメールを頂いたので、スクリプトの勉強を兼ねて試してみました。


●　リンデンスクリプトでＰＤＢファイルを読み込む。(PDB：蛋白質構造データバンクProtein Data Bank)

　　PDBファイルの抜粋ですが、こんなフォーマットです。

　　（NH3：アンモニア）
　　HETATM　1　N　　-0.010　-0.005　-0.123
　　HETATM　2　H　　-0.512　0.840　-0.252
　　HETATM　3　H　　-0.516　-0.842　-0.281
　　HETATM　4　H　　0.935　-0.002　-0.425
　　CONECT　1　2　3　4
　　CONECT　2　1
　　CONECT　3　1
　　CONECT　4　1
　　END

見てすぐわかるとおり、Uniq ID、原子名、空間座標、結合情報、からできてます。
これを、スクリプトで読み込んで、スフィアやシリンダをＲＥＺしただけです。
PerlやRuby等で、PDBをOBJ形式に変換すれば、BlenderやShadeで読み込むこともできます。

昔、学校で建築ＣＡＤの授業があって、操作のほかに、いろいろ作画コマンドをＣ言語で作ったん
ですが、（壁と床が接しているかの干渉計算とか、ベクトルの計算とか）
そのころの知識が意外と役立ちそうな気がします。＾＾;


●　Cyclodex　（酵素の一種）




●　芳香族や炭素多面体などには、アクセサリにも使えそうな形がたくさんあります。^^




●　宇宙ステーションが作れそうです。





【使用上の注意】

１．できた分子構造に、物理属性を与えるのはやめましょう　（特に斜面の土地などで。。。。）　＾＾；
２．作りすぎに注意しましょう。　（ＤＮＡ核酸をＲＥＺしたいな～。。）